奥特战士与贝利亚之间的战斗被地球人奉为传说一直流传了下来。在六年前的地球上曾出现过怪兽，那场混乱平息之后，人们一直过着和平的日子。主人公朝仓陆从小不知道自己的双亲是谁。他在小时候遇见了佩嘉萨星人——佩嘉，他目前住在星云庄内，是一位崇拜英雄的普通青少年。某天，六年前的怪兽再次出现！星云庄被它肆意践踏，小陆和佩嘉不知该逃往何处，此时他们意外地发现了藏在地底的秘密基地。从基地的莱姆那里拿到了“奥特胶囊”的小陆，变身成了捷德奥特曼！这位奥特战士成功击退了怪兽，但他的外形却酷似贝利亚。在那之后，怪兽们接二连三地出现，它们的目标都是能源体“利特鲁之星”。这一连串的事件背后隐藏着贝利亚的阴谋，察觉到这一点的赛罗奥特曼来到了地球。继承了贝利亚遗传基因的小陆，他与命运抗争，想要成为真正的英雄，战斗就此展开！